Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNC3Q14003 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNC3Q14003 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms