Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CBFBQ13951 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms