Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CCINQ13939 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCINQ13939 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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