Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLF9Q13886 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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