Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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