Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSTA3Q13630 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms