Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C1orf61Q13536 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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