Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PMS2P3Q13401 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms