Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SGCGQ13326 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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