Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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IFT88Q13099 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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IFT88Q13099 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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IFT88Q13099 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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IFT88Q13099 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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IFT88Q13099 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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