Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK3Q13003 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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