Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COX10Q12887 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COX10Q12887 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
COX10Q12887 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
COX10Q12887 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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