Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STX4Q12846 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
STX4Q12846 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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