Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFEMP1Q12805 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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