Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLEQ07864 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLEQ07864 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms