Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP1-1Q07627 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms