Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNB3Q05901 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms