Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CALD1Q05682 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALD1Q05682 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms