Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NOTCH2Q04721 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NOTCH2Q04721 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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