Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAV1Q03135 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms