Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms