Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MDM2Q00987 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MDM2Q00987 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms