Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK17Q00537 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK17Q00537 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms