Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

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Length 3,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RELNP78509 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RELNP78509 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RELNP78509 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RELNP78509 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RELNP78509 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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