Protein–RNA interactions for Protein: P57086

SCAND1, SCAN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAND1P57086 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCAND1P57086 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms