Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP7P55210 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms