Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRISP1P54107 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms