Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGGT1BP53609 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PGGT1BP53609 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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