Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms