Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GBX2P52951 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GBX2P52951 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GBX2P52951 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GBX2P52951 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GBX2P52951 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
GBX2P52951 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBX2P52951 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBX2P52951 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms