Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX5P45973 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms