Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ETV4P43268 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ETV4P43268 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ETV4P43268 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ETV4P43268 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ETV4P43268 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms