Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms