Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms