Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXC13P31276 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms