Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP1P29466 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP1P29466 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP1P29466 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms