Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCAP28676 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCAP28676 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCAP28676 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms