Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAMP1P23763 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAMP1P23763 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms