Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SPRR1BP22528 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms