Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB1P20618 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB1P20618 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms