Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRHP20396 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRHP20396 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRHP20396 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRHP20396 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRHP20396 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRHP20396 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms