Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD53P19397 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD53P19397 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD53P19397 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD53P19397 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD53P19397 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms