Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB9P17482 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms