Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CREB1P16220 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CREB1P16220 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CREB1P16220 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms