Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPBP14678 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPBP14678 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms