Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM27P14373 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms