Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms