Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD2P0DJD1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD2P0DJD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms