Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOL3O95236 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL3O95236 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms