Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms